结膜炎治理应该局部用药为主，必要时全身用药，急性期禁忌包扎。针对微生物性结膜炎，选用敏感的抗生素或抗病毒眼药水滴眼，急性期每1-2小时1次，好转后减少滴眼次数。
晚上睡觉前涂眼膏。当结膜囊分泌物比较多时，用生理盐水每天冲洗1-2次，注意不要让冲洗液流入好眼。对于严重的结膜炎，比如淋球菌性结膜炎和衣原体性结膜炎，除了局部用药，还需全身使用抗生素。
结膜炎的治疗，可以利用局部治疗，就是冲洗结膜囊，其作用主要是清洁，不要遮盖眼睛，因结膜炎时分泌物很多，如果把眼遮盖，分泌物不易排出，而集存于结膜囊内，就会加重结膜炎的症状。
其实对于结膜炎的治疗都是需要用药水治疗的，都是可以减轻病情的，每天坚持用冷水浸湿的毛巾敷眼睛，有助于消肿退红，每天细心地护理眼部、经常保持眼部的清洁很重要，并注意个人卫生，保持手的清洁，不要用手揉眼并须勤洗手。
一般急性结膜炎，是由微生物感染引起的，比如沙眼衣原体、肺炎链球菌、流感嗜血杆菌、金黄色葡萄球菌、腺病毒、肠道病毒感染等引起的。还有一种过敏性结膜炎，是和花粉过敏，各种微生物蛋白，动物皮屑和羽毛等过敏原，所引起的过敏性的结膜炎。
得结膜炎后会感觉到不舒服，眼睛怕光流泪或摩、涩，长期造成生活困扰，特别是对生活要求质量高的人得结膜炎会特别难受。在生活质量方面，严重的结膜炎有分泌物或眼睛水肿，影响正常的工作。长期的结膜炎有可能并发角膜炎，角膜炎会引起视力下降对生活造成严重影响，还有过敏性结膜炎是季节性引起过敏性结膜炎，过敏性结膜炎患者经常眼睛过敏加重，眼睛不能睁开。
结膜炎的治疗，主要是注意休息，保持心情愉悦，注意用眼，特别是手机，电脑一定要控制，避免吃刺激性的食物，比如辣椒，避免揉眼睛，注意生活安全，避免外伤，可以使用修复性的眼药水。
不要遮盖患眼：因结膜炎时分泌物很多，如果把患眼遮盖，分泌物不易排出，而集存于结膜囊内;且遮盖后会使结膜囊温度升高，更有利于细菌的繁殖，使结膜炎加剧。如果病人畏光，可戴遮光眼镜。对于严重的结膜炎，需结合全身用药治疗。结膜炎患者要勤洗于，避免随意揉眼。提倡流水洗脸，毛巾、手帕等物品要与他人分开，并经常清洗消毒。
可以滴用抗生类药水，每日应用2～3次，具有良好疗效。注意避光 应在光线较暗的房间休息，避免强光刺激引起的不适。避免传染他人 患者用过的洗脸用具、手帕等物品要消毒，家庭可用煮沸消毒法。不与其他人共用洗脸毛巾和脸盆，避免传染给他人。 因眼的分泌物具有很强的接触传染性，所以在分泌物多时尽可能不要外出。
依据病因可分为局部和全身治疗。如感染性结膜炎则抗感染、抗病毒、抗真菌治疗。如过敏性结膜炎则抗过敏治疗，甚至运用皮质类，固醇类的药物进行治疗。另外，应结合局部洗眼，中医中药的治疗，如中药熏眼等，可缩短病程，疗效较好。
结膜炎的治疗就是用一些消炎的药物或者抗身素的药物治疗，这个期间还要注意不要用手部揉眼睛，避免一些细菌或者病毒的感染，日常的生活中不要吃一些过于辛辣刺激油腻的食物，还是要以清淡饮食为主。
患病期间每天坚持用冷水浸湿的毛巾敷眼睛。慎用激素类眼药。急性眼睛结膜炎初起时眼部宜作冷敷，有助于消肿退红。而在炎症没有得到控制时，忌用激素类眼药，每天细心地护理眼部、经常保持眼部的清洁特别重要，用生理盐水清洗眼部或眼浴，再滴入眼药才能充分发挥其药效。