结膜炎的治疗原则是针对病因治疗，局部用药，必要时全身用药。急性期禁止包扎患眼，滴眼药水时要注意滴眼液切勿流进好眼，当结膜囊内分泌物较多时，可用生理盐水冲洗患眼，勿让液体流进好眼，以免传染好眼。
患有较严重的结膜炎，则需全身静点抗炎药，如由化学液体进入引起的结膜炎，需要立即用生理盐水冲洗或就近选择干净的水冲洗，冲洗后马上到医院检查，非感染性因素引起的结膜炎，要注意休息，缓解疲劳，远离过敏原等方法治疗。
结膜炎是因为上火，劳累，熬夜，用眼过度，缺乏户外运动，导致了视疲劳，干眼症和结膜炎。要保持心情愉悦，注意休息，注意用眼，特别是手机，电脑等，尽量少用，多看远处，多运动，可以做眼部的热敷，眼保健操。
治疗结膜炎首先要查找病因，消除致病因素，而后针对不同致病原因进行恰当处理。对细菌引起者给予适当抗生素眼药水及眼膏，同时加用适量的收敛性眼液。非细菌性者在查找原因并去除的基础上，局部给消炎眼药水或适量皮质类固醇眼药。
有结膜炎需要检查明确之后，选择相应的抗生素来进行抗感染治疗，有助于改善局部的不适症状。在进行抗感染的同时，还要注意加强营养支持，多吃一些富含蛋白和维生素的食物，以提高机体的免疫力。同时要保护好眼睛，避免出现用眼疲劳的情况。
治疗结膜炎应该冲洗结膜囊，其作用主要是清洁，常用者为生理盐水。不要遮盖患眼，因结膜炎时分泌物很多，如果把患眼遮盖，分泌物不易排出，而集存于结膜囊内，且遮盖后会使结膜囊温度升高，更有利于细菌的繁殖，使结膜炎加剧。
结膜炎要积极治疗，这种病通常会逐渐自动复原。为了加速复原，可用棉球沾清水或无菌水，擦除分泌物，保持眼部清洁。也可以将毛巾放在温水里浸湿，然后挤干水，放到眼睛上敷5-10分钟，眼睛会舒服许多。
膜炎可以引起眼睛疼痛不适，可以注意休息，应用眼科检查，应用消炎滴眼液等，饮食清淡注意休息，避免长期熬夜上网玩手机等劳累，养成良好的卫生习惯，减少接触吸烟及燃烧废弃物之烟灰。
压力太大，过度的劳累，睡眠缺乏，用眼不合理，身体抵抗力下降等引起的结膜炎有关系。建议，一般生理盐水有清洁，消炎的作用，但除非眼部的分泌物特别多，要在医院，让医生给你做结膜囊冲洗，不建议自己操作，以免导致结膜，角膜损伤。
患上结膜炎之后，可以使用抗生素进行治疗，提倡勤洗手，避免随意揉眼。提倡流水洗脸，毛巾、手帕等物品要与他人分开，并经常清洗消毒。在饮食上也要注意清淡，不要吃上火和辛辣刺激性的食物。
结膜炎可以做分泌物常规检查看看的，可以用消炎药物医治。同时注意休息，注意用眼，如是手机，电脑等，少用，注意保暖，多喝水，多吃些含维生素的水果，比如草莓，樱桃，柠檬等，而且适当的运动，比如散步，增强抵抗力。
结膜炎初起时眼部宜作冷敷，有助于消肿退红。要让眼部避光避热，并且少用眼。为减轻不适，要避免光和热的刺激。为了使眼部分泌物排出通畅，降低局部温度、不利于病菌繁殖生长，眼部不可包扎或戴眼罩。